Мы живем в век унификации и WordPress не исключение, все темы строятся по одному шаблонному расположению файлов, хотя есть и исключения. Но в подавляющем большинстве если пройти по пути wp-content/themes/<название вашей темы>/, то мы увидим примерно такую картину, смотрим скрин.
На изображении корень каталога темы для WordPress премиум класса, но суть не меняется, у вас может быть побольше файлов и папок, может быть поменьше. Но там у вас всегда будут файлы index.php, header.php и footer.php. Это не все обязательные файлы для темы шаблона WordPress, кому интересно читаем в CODEX WordPress тут.
А дальше пожеланию запихиваем код или в header.php там между тегами head, или в footer.php перед закрывающим body. Кому как вера позволяет и предубеждения. На этом все, успеха тебе друг!
коммент.